渔药使用的最终目的是提高水产动物的抗病能力，控制水产动物疾病的发生。其基本作用大体可分为三类：
1.抑制和杀灭病原体。抗微生物药和抗寄生虫药等，经吸收进入机体与器官组织后，直接与病原体发生作用。
2.改良养殖环境。通过杀灭水中的病原体、改良水质与底质、净化养殖环境而达到改良养殖环境的目的。
3.调节水产动物的生理功能。为了更好的提高饲料转换率，常在饲料中添加一些能调节代谢和促进生长的药物，这些添加剂一般不具有诊断和治疗疾病的作用，大多用作改进饵料利用率。目前在水产养殖生产中常用的调节水生动物代谢及生长的药物主要有矿物质、维生素、氨基酸、脂质、激素、酶制剂等。
1.泼洒法：又称全池遍洒法。采用对某些病原体有较大的杀灭效果，而对鱼、虾类等动物安全的药物，以一定的浓度，均匀地泼洒在养殖水池中的一种方法。使用该法时必须正确计算出养殖水体的体积和用药量。
2.悬挂法：也称挂篓（袋）法。即将药物装在有微孔的容器或布袋中，悬挂于食物周围或水产动物常出没的地方，利用养殖动物到食场摄食或生存活动的习性达到给药的目的。
3.浸浴法：又称浸洗法。将养殖动物集中在较小的容器或水体内，配制较高浓度的药液，在较短时间内强制受药，以杀死其体表和腮上的病原体。
4.浸沤法：将采集到的中草药扎成捆，投放在养殖池塘的食场附近或池塘进水口处、上风头处等位置浸沤，利用浸沤出的有效成分扩散到养殖池塘中，抑制或杀死水中及鱼体表、鳃上的病原体。
5.涂抹法：又称涂擦法。捕起患病水生动物，用湿纱布或毛巾将水生动物包裹住，然后直接将药液滴在病灶处或用棉花蘸药液涂抹，以杀死病原生物或防止伤口被感染。
6.内服法：将药物均匀地混合到饵料中，制成适口的药饵后投喂。给药的剂量一般根据养殖种类及其体重计算，也有的按饵料重量计算。
7.灌服法：实际是一种强制性内服法。该法是将水生动物麻醉，然后用橡胶导管把调制好的药液灌入胃或肠，灌闭将其放于盛有清水的容器中暂养，直至病愈或视病情进行第二次灌药。此法一般只适用于少量的大型水生动物。
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